Le attività istituzionali dell'Ente consistono principalmente nel soccorso e trasporto di ammalati, infortunati e disabili o altri servizi di trasporto sanitario. La Croce Verde di Padova prevede una organizzazione basata su gruppi operativi per garantire l'efficienza del servizio e lo sviluppo della vita associativa consentendo un utilizzo ottimale delle risorse umane e tecniche.

Durante il servizio diurno l'Ente si avvale della presenza di autisti e centralinisti dipendenti che garantiscono la continuità del servizio, fermo restando che gli equipaggi sono comunque formati da volontari. In questi ultimi anni è stata stipulata una convenzione con il Ministero della Difesa che prevede la presenza di obiettori di coscienza i quali svolgono il periodo di leva all'interno dell'associazione.
Il servizio notturno, la domenica ed ogni altra festività sono gestiti interamente dai volontari costituiti in squadre, una formazione permanente diretta da Capisquadra.

Nell'ultimo decennio l'esigenza di una presenza capillare sul territorio ha portato alla costituzione di tre sedi decentrate (Albignasego, Cadoneghe e Tencarola) organizzate allo stesso modo della Sede Centrale.